我是胃肠肝胆外科医生，我来回答这个问题。
其实，这两个结果并不冲突，可以理解为是同一个结果。当然，两个结果的发报告形势不同，所以诊断上有差异。
胃镜的报告，是内镜肉眼下直视胃粘膜的改变，描述的是直观的病理改变，即我们医生说的“大体病理”，是外在表现，未深入到细胞层次。
正常胃粘膜镜下观看呈粉红色，萎缩性胃炎的镜下表现为：胃粘膜红白相间，以白为主。就好比绿草地与秃山（如图）。白的地方，是因为胃粘膜萎缩，血管硬化引起；红的地方是有炎症的胃粘膜，血管充盈，这些是慢性表现。而胃粘膜糜烂，却是急性炎症表现。
病理诊断报告，趋向于内在表现，深入到细胞层次，是从微观方面描述胃粘膜的改变。因为其有唯一性，所以我们称病理检查结果为“金标准”。
综合上述描述，萎缩性胃炎属于慢性胃炎，糜烂是急性胃炎表现。所以两者诊断皆没有错，只是发报告形势不同而已。其实最严谨的诊断应该是：慢性萎缩性胃炎伴急性糜烂性胃炎发作。题者需要关心的不是诊断，而是疾病出现病情变化，是导致腹痛频繁发作的主要因素，建议到消化内科规范用药治疗。
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